Sa larong Muscle Girl Calorie Run tutulungan mo ang isang batang babae na atleta na magsanay sa isang isport tulad ng pagtakbo. Sa harap mo sa screen makikita mo ang isang gilingang pinepedalan kung saan lilipat ang iyong karakter. Habang kinokontrol ang pagtakbo ng babae, kailangan mong iwasan ang mga hadlang at bitag. Sa daan, tutulungan mo siyang mangolekta ng masustansyang pagkain na magbibigay sa kanya ng lakas. Sa larong Muscle Girl Calorie Run, kailangan mo ring iwasan ang mga nakakapinsala at mataas na calorie na pagkain.