Ang mga pindutan ay isang karaniwang paraan ng pagkontrol sa mga laro, at sa Button Puzzle sila ang mga pangunahing. Sa bawat antas, magbabago ang kanilang set sa ibaba ng screen at ito ay minimal na kinakailangan. Sa pamamagitan ng pag-click, ililipat mo ang karakter upang mangolekta siya ng mga asul na bato, at pagkatapos nito ay lilitaw ang isang pinto upang lumabas sa antas.