Sa larong Clone Jumping, magkakaroon ka ng pagkakataong kontrolin ang dalawang cube na character sa parehong oras, na diumano ay mga clone ng bawat isa. Kung gumagalaw ang isa, ganoon din ang gagawin ng isa. Ito ang iyong magiging pangunahing balakid sa pagkumpleto ng mga gawain sa bawat antas. Ang layunin ay ihatid ang parehong mga cube sa mga round portal. At tandaan na eksaktong kopyahin nila ang isa't isa sa Clone Jumping.